مرکز ارتباطات ستادکل نیروهای مسلح در بیانیه‌ای هرگونه شبهه‌افکنی درباره چگونگی و علت شهادت آیت‌الله سیدابراهیم رئیسی و همراهانش را رد کرده و اظهارنظرهای غیرمسئولانه را ناشی از ناآگاهی یا اهداف خاص دانسته است. در این بیانیه تأکید شده است که اخیراً در فضای مجازی و برخی محافل، ادعاهایی مطرح می‌شود که با واقعیت فاصله دارد و به نظر می‌رسد این اظهارات یا ناشی از بی‌اطلاعی است یا با اهداف خاصی بیان می‌شود.
این بیانیه اشاره می‌کند که بر اساس سه گزارش رسمی ستادکل نیروهای مسلح، که نتیجه صدها ساعت کار کارشناسی و تحقیقات فنی و میدانی در سطح ملی و محلی است، علت سانحه بالگرد حامل آیت‌الله رئیسی و همراهانش تنها شرایط پیچیده جوی و جغرافیایی منطقه بوده است. در گزارش نهایی این ستاد تأکید شده که هیچیک از گمانه‌زنی‌ها مانند نقص فنی، خرابکاری، ترور، انفجار یا جنگ الکترونیک تأیید نشده است.
ستادکل نیروهای مسلح از رسانه‌ها، افراد حقیقی و حقوقی و نمایندگان مجلس شورای اسلامی درخواست کرده است که از اظهارنظرهای غیرکارشناسی و احساسی که تنها باعث تشویش اذهان عمومی و سوءاستفاده دشمنان می‌شود، خودداری کنند و از هرگونه شبهه‌افکنی در این زمینه پرهیز نمایند.
همچنین انتظار می‌رود دستگاه قضایی به عنوان مدعی‌العموم، با افرادی که امنیت روانی جامعه را بر هم می‌زنند، برخورد قانونی مناسب انجام دهد.