مقامات ایرانی برای مدتی توضیح رسمی درباره دلیل انفجاری که در بندر شهید رجایی به وقوع پیوست، ارائه ندادند و تنها م Liability کردند این حادثه با صنایع نفتی کشور ارتباطی ندارد. اما شرکت امنیتی خصوصی م apprehension امبری از بریتانیا اعلام کرد که این بندر در مارس محموله‌ای از سوخت موشکی سدیم پرکلرات دریافت کرده بود. بر اساس گزارش فایننشیل تایمز، این محموله بخشی از حملاتی بود که با دو کشتی از چین به ایران ارسال شده بود، موردی که ممکن بود برای تجدید ذخایر موشکی ایران پس از حملات مستقیم به اسرائیل در حملات غزه مورد استفاده قرار گیرد.
موسسه ام�ری اعلام کرد که آتش‌سوزی ممکن است به دلیل حمل و نقل نادرست مواد جامد سوختی رخ داده باشد که برای استفاده در موشک‌های بالستیک ایران مورد استفاده قرار می‌گرفت. داده‌های ردیابی کشتی‌ها نیز نشان می‌دهد که یکی از کشتی‌هایی که این ماده را حمل می‌کرد، در مارس در این منطقه حضور داشت. ایران تاکنون پذیرش رسمی دریافت این محموله را انجام نداده و نماینده ایران در سازمان ملل هم روز شنبه به درخواستهای مصاحبه به جواب نداده است.
اگر این ادعاهای صحت داشته باشند، علت برخورداری ایران از انتقال این مواد پس از دریافت آن‌ها مشخص نیست، به‌ویژه با توجه به حوادث مشابه مانند انفجار 2020 در بندر بیروت. عکس‌هایی که از انفجار بندر شهید رجایی منتشر شده، دود قرمز اعزام شده را نشان می‌دهند که احتمالا به دخالت مواد شیمیایی اشاره دارد.
خبرگزاری دولتی ایرنا اعلام کرد که اداره گمرک ایران، انبار مواد خطرناک و شیمیایی را عامل اصلی انفجار معرفی کرده است. حسین ظفری، سخنگوی سازمان مدیریت بحران ایران، علت انفجار را حفظ نامناسب مواد شیمیایی در کانتینرها ذکر کرد. او همچنین گفت که مدیرکل مدیریت بحران قبل از حادثه به این خطر هشدار داده بود.
با این حال، سخنگوی دولت ایران اعلام کرد که هنوز تعیین دقیق علت انفجار میسر نیست. مسعود پزشکیان، رئیس‌جمهوری ایران، دستور تحقیقات در این زمینه را صادر کرد و وزیر کشور را به جهت نظارت بر مهار آتش و جلوگیری از گسترش آن به بندر فرستاد.
در سال‌های اخیر، ایران شاهد حوادث مختلفی به همراه همچون آتش‌سوزی‌ها، انفجارهای گازی و دیگر حوادث مرگبار در است. این حوادث متعددی به تقصیر و سهل‌انگاری نسبت داده شده‌اند. برخی از این حوادث نیز از سوی ایران به حملات اسرائیلی نسبت داده شده است، از جمله حملاتی که هدف آن‌ها سیستم‌های دفاع جوی ایران بود. ایران همچنین حمله به خطوط لوله گاز در فوریه 2024 را نیز به اسرائیل نسبت داده است.
نگرانی‌های اسرائیل از مذاکرات بین ایران و آمریکا نیز تاکید شده است. تهران همچنان تأکید می‌کند که برنامه هسته‌ای خود صرفاً برای اهداف صلح‌آمیز است، اما ناظران بین‌المللی هشدار داده‌اند که ایران به نزدیکی از توانایی ساخت سلاح هسته‌ای پیش رفته است. پس از انفجار 26 اپریل، دفتر نخست‌وزیری و ارتش اسرائیل از اظهار نظر درباره احتمال دخالت اسرائیل در این حادثه خودداری کردند.