در یادداشت‌های خود، آیت‌الله هاشمی رفسنجانی به روایت روز چهاردهم خرداد سال 1368 و مراحل انتخاب رهبری پرداخته است. به گزارش جماران، ایشان در روزهای پایانی عمر امام خمینی (ره) با مسئولیت‌های سنگین روبرو بودند. آیت‌الله رفسنجانی در یادداشت‌هایش اشاره می‌کند که چهاردهم خرداد ماه، پس از نماز، به مجلس رفت و مشاهده کرد که اعضای هیئت رئیسه خبرگان در دفترش خوابیده‌اند. مذاکراتی درباره برنامه جلسه خبرگان برگزار شد. اعضای خبرگان از سراسر کشور به تهران رسیده بودند و جلسه در تالار مجلس آماده شد.
جلسه غیررسمی بود و ایشان همراه با نمایندگان خبرگان گریه زیادی کردند. آیت‌الله رفسنجانی می‌گوید که به نظرش گریه برای کاهش فشار روحی مفید بود. او احساس می‌کرد که در این جلسه، حضور و تصAoی-bه او به روحیت آرامش آفرینی و امیدبخشی کمک کرد. حضور آیت‌الله خامنه‌ای و آیت‌الله مشکینی نیز بسیار اثربخش بود. در این جلسه غیررسمی، طرح شد که مدت مسئولیت هیئت بازنگری یک هفته تمدید شود. بیانیه‌ای نیز برای خبرگان در خصوص رحلت امام تهیه شد.
حدود ۳۰/۸ جلسه آماده و رسمیت جلسه به اعلان رسید. آقای مشکینی صحبت کوتاهی کرد. وصیت‌نامه امام که در صندوق امانات در دفتر آیت‌الله رفسنجانی نگهداری می‌شد، در جلسه رسمی پلمب شکسته شد و بیرون آورد. این وصیت‌نامه در سال 1361 نوشته شده و در سال گذشته تجدیدنظر یافته بود. در آخر وصیت‌نامه، نام احمدآقا، رئیس جمهور، رئیس مجلس و رئیس دیوان عالی کشور و یکی از اعضای شورای نگهبان برای خواندن به مردم ذکر شده بود. احمدآقا اطلاع داد که آمادگی ندارد؛ بنابراین نوبت به رئیس جمهور رسید و آیت‌الله خامنه‌ای برای حضور وصیت‌نامه را خواند. حاضران جلسه، نمایندگان مجلس، دولت، شورای نگهبان، شورای عالی قضایی و سایرین بودند. قرائت وصیت‌نامه دو ساعت و نیم طول کشید و نزدیک ظهر جلسه خاتمه یافت.
جلسه بعدازظهر با صحبت آیت‌الله مشکینی شروع شد و تا ساعت ۳۰/۷ عصر با یک تنفس ادامه یافت. در این جلسه صحبت‌های متعددی صورت گرفت. برخی از حاضران طرفدار رهبری شورایی و برخی دیگر طرفدار رهبری فردی بودند. اسم‌هایی مانند آقایان موسوی اردبیلی، مشکینی، احمدآقا و آیت‌الله خامنه‌ای برای رهبری جدید پیشنهاد شد. در نهایت، آیت‌الله خامنه‌ای با اکثریت قاطع ۶۰ رأی از ۷۴ رأی اعضا به عنوان رهبر جدید انتخاب شد. مسئله به این خوبی حل شد.
در خرداد ماه ۱۵، آیت‌الله رفسنجانی متن بیانیه مجلس خبرگان در خصوص تصویب رهبری آقای خامنه‌ای را نوشت و برای انتشار آماده کرد.