مرکز ارتباطات ستادکل نیروهای مسلح در بیانیه‌ای رسمی، هرگونه شبهه‌افکنی درباره چگونگی و دلایل شهادت آیت‌الله سیدابراهیم رئیسی و همراهانش را رد کرد و اظهارنظرهای غیرمسئولانه در این زمینه را ناشی از بی‌اطلاعی یا اهداف خاص دانست.
در این بیانیه تأکید شده است که اخیراً در فضای مجازی و برخی محافل، ادعاهایی مطرح می‌شود که با واقعیت فاصله زیادی دارد و به نظر می‌رسد این اظهارات یا از روی ناآگاهی است یا با اهداف خاصی بیان می‌شود. این در حالی است که بر اساس سه گزارش رسمی ستادکل نیروهای مسلح، که پس از بررسی‌های دقیق کارشناسی و تحقیقات فنی و میدانی در سطح ملی و محلی تهیه شده، علت سانحه بالگرد حامل آیت‌الله رئیسی و همراهانش تنها به دلیل «شرایط پیچیده جوی و جغرافیایی منطقه» بوده است. در گزارش نهایی این ستاد، هیچ‌یک از گمانه‌زنی‌ها مانند نقص فنی، خرابکاری، ترور، انفجار یا جنگ الکترونیک تأیید نشده است.
ستادکل نیروهای مسلح از رسانه‌ها، افراد حقیقی و حقوقی و نمایندگان مجلس شورای اسلامی خواسته است از اظهارنظرهای غیرکارشناسی، احساسی و غیرمسئولانه که تنها باعث ایجاد تشویش در افکار عمومی و سوءاستفاده دشمنان می‌شود، خودداری کنند و از هرگونه شبهه‌افکنی در این زمینه پرهیز نمایند.
همچنین انتظار می‌رود دستگاه قضایی به عنوان مدعی‌العموم، با افرادی که امنیت روانی جامعه را برهم می‌زنند، برخورد قانونی مناسب انجام دهد.